种质冷冻保存平台依托于中国水产科学研究院黄海水产研究所，主要包括精子库、胚胎细胞库、基因库，是我国重要的水产养殖动物精子、细胞保藏及基因资源利用的专业平台，致力于我国水产养殖动物的种质收集、保藏以及基因功能挖掘。
　　从“十五”至“十四五”期间，在国家863计划、国家重点研发计划、国家自然科学基金、山东省泰山产业领军人才工程、山东省重点研发计划等项目的资助下，种质冷冻保存平台已完成多种海、淡水鱼类及其它水产动物的精子的冷冻保存研究，建立了水生动物精子的超低温冷冻保存技术，共收集52种海淡水鱼类的精子，保存鱼类精子12380份；并且将冷冻精子应用到鱼类选择育种、杂交育种和性别控制等研究领域，促进了我国海水鱼类遗传育种和苗种繁育的发展。在胚胎冷冻保存方面，研究团队在国际上首次建立了海水鱼类胚胎玻璃化冷冻保存技术体系，突破了海水鱼类胚胎冷冻保存技术难关，多次在鲆鲽鱼和石斑鱼中获得冷冻复活的胚胎和鱼苗，冷冻胚胎成活率和孵化率分别达到12.19%和28.87%。在海水鱼类细胞培养和细胞系建立方面，建立花鲈和真鲷胚胎干细胞系，开辟我国海水鱼基因打靶研究领域；建立半滑舌鳎、大菱鲆、牙鲆、石斑鱼、黄唇鱼、黄带拟鲹等海水鱼性腺、皮肤、肾脏、脑、鱼鳔等50多种组织细胞系（每种细胞约50份），目前在海水鱼类细胞资源库中处于国内领先地位。建立中华鲟、长江鲟、圆口铜鱼、黑尾近红鲌等珍稀濒危鱼类胚胎、皮肤、性腺、肾脏、鳍条等20余种细胞系，每种细胞保存约30余份，已应用于免疫学、干细胞分化等研究领域。在基因组信息资源方面，研究团队利用新一代测序技术对半滑舌鳎、牙鲆、鞍带石斑鱼、蓝身大斑石斑鱼、云纹石斑鱼、南极鳞虾等10多种水产动物全基因组进行测序、组装和分析，绘制了染色体水平精细图谱。在种质资源库基础上开展了鲆鲽鱼、石斑鱼类选择、杂交育种研究，培育出“鲆优1号”“鲆优2号”“鳎优1号”“云龙石斑鱼”“金虎杂交斑”等鱼类新品种，在鱼类新种质创制和产业化应用方面发挥了重要作用。
　　本平台致力于成为中国保存种类和样品备份最多、规模最大、功能最强的公益性渔业种质资源细胞库，同时建成与细胞库实物一一对应的标准和规范的数据档案，对每份保存样品的来源、属性、特征、保存状态及应用范畴都制定规范，与国内外科研机构实现信息聚合和共享、样品交换、样品应用等国内外合作交流，向国内外科研与产业单位提供服务，也将技术广泛应用于海水养殖动物病源分离、疫苗研制、病害防治、基因打靶、基因功能分析、细胞工程育种、动物克隆和物种保护等领域，推进渔业可持续发展、水产动物资源的保护、合理开发和利用。