纪晓峰,博士,助理研究员,2007年3月毕业于华中科技大学生物物理专业,同年4月进入黄海水产研究所海洋产物资源与酶工程实验室工作至今。多年来,主要从事生物信息学和结构生物学的研究,包括蛋白质序列与结构分析,基于序列分析的蛋白质结构、功能预测,蛋白质分子动力学模拟和基于分子对接模拟的功能酶及抑制剂的筛选等。目前主要通过计算生物学方法进行海洋天然产物和新型工具酶的发现与优化,以酶与底物相互作用的角度研究酶对底物的特异性识别以及酶对底物的催化与转化过程;通过药物筛选的方法,进行活性多肽在水产生物病害防治中的应用等研究。来共发表文章30余篇,申请授权发明专利10余项,参与主持国际科技合作重点项目,国家自然科学基金以及中央级科研院所基本科研业务费等项目多项。
主要研究方向:海洋活性蛋白结构功能关系,海洋活性产物的虚拟筛选,蛋白质-多肽,蛋白-小分子相互作用
代表性论文:
[1]Xiaofeng Ji, Yanzhao Huang, Jun Sheng. Structural modeling of Nav1.5 pore-domain in closed state,Biophysics reports, 2021, 7(4): 341-354.
[2]Xiaofeng Ji, Yuan Zheng,Jun Sheng. Prediction of Interaction Sites of PcRab7-VP28,Computational Molecular Bioscience, 2021, 11: 50-56.
[3] Lu Liu, Zhipeng Wang, Zhihong Zheng, Ze Li,Xiaofeng Ji*, Haihua Cong*, Haiying Wang*, Secretory Expression of an Alkaline Alginate Lyase With Heat Recovery Property in Yarrowia lipolytica,Frontiers in Microbiology, 2021, 12: 0-710533.
[4]纪晓峰,郑媛,王致鹏,盛军,王海英,4-甲酰苯基硼酸对蛋白酶MP的抑制作用及其抑制机制的分子动力学模拟,2018,中国生物化学与分子生物学报,34(6):45-52.
[5]Xiaofeng Ji, Yi Xiao and Shiyong Liu. Structural modeling of human cardiac sodium channel pore domain.Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 2017,Jul 13: 1-11.
代表性发明专利
[1]纪晓峰,盛军,郑媛,王致鹏,基于进化耦合分析的电压-门控钠离子通道结构模建方法, 2021-3-19, 中国, ZL201711159188.4
[2]纪晓峰,盛军,郑媛,郝建华, 一种蛋白互作阻断多肽的辅助筛选方法, 2021-12-14, 中国, ZL202010950586.3
[3]纪晓峰,盛军,郑媛,王致鹏,一种电压-门控钠离子通道的结构预测方法, 2020-7-3, 中国, ZL201710545391.9
[4]Xiaofeng, Ji;Yuan, Zheng and Jun, Sheng,Virtual screening method for small molecular reversible inhibitors of flavobacterium alkaline metalloproteinase,2021-7-5, Australia, 2021103877.
[5]郑媛, 盛军,纪晓峰, 一种壳聚糖酶及其突变体在制备壳寡糖中的应用, 2021-3-3, 中国, CN202110237365.6 (专利)
[6]王海英,王致鹏,纪晓峰,一种具有pH广泛稳定性的适冷褐藻胶裂解酶AlgL2及其应用, 2020-3-12,中国, CN202010170519.X (专利)