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海大发布国际首个软体动物综合基因组数据库

日期:2020-11-02 10:28    作者:    来源:青岛日报     打印    加大 减小

日前,中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室包振民院士团队取得重要成果,在国际数据库领域顶级期刊《核酸研究》在线发表了国际首个软体动物综合基因组数据库。

随着基因组学数据以史无前例的规模增长,深度挖掘复杂高维度的海量组学资源已成为当前生命科学领域面临的巨大挑战。构建系统便捷、功能全面的基因组学数据库在解决这一难题上发挥着重要作用。当前,国际上广泛使用的大型公共基因组数据库仍主要聚焦并服务于人类医学及小鼠、斑马鱼、果蝇等模式生物研究。对非模式生物类群(如大部分海洋生物)而言,至今缺乏适当的整合平台及深度分析工具,以满足日益增长的对复杂海量组学数据的分析需求。

软体动物起源于5亿年前早寒武纪,是进化最成功的无脊椎动物群体之一。软体动物现存种类高达10万种以上,是动物界中仅次于节肢动物的第二大门类。研究团队通过广泛收集软体动物基因组学资源,系统梳理整合多组学数据及开发丰富的分析工具,构建了迄今物种覆盖度最广、组学资源最丰富、功能最全面的软体动物基因组学分析平台MolluscDB。